术后“继发性”出血
轻微的、自限性阴道出血（点滴出血）并不少见（尤其是在发情时进行绝育），这种情况不视为并发症。不过不少人记录过严重的，甚至危及生命的出血病例，除了坊间报道，有人更是亲眼见证过病例情况。1973年，Pearson在回顾了72例犬卵巢子宫切除术后并发症中，将11例患犬描述为“继发性出血”这个症状，他记录的发病时间为术后4-16天内，一些病例为间歇性发病，病情随时间推移愈发严重，而其他病例则表现更严重的急性症状。
无论何种症状，出血的严重程度都可能迅速上升——在某些病例中，数小时内就会达到致命水平。据Pearson推测，发病诱因是结扎点以下的子宫血管糜烂，感染可能来自先前就存在的子宫蓄脓，又或来自无菌操作中的漏洞。
本文作者的经验证实了Pearson观察到的现象，即子宫体结扎点下方的子宫血管破损似乎是最有可能导致出血的原因，但无法证实也不能排除感染是糜烂的根本原因。解决方法为再次切除子宫残端并重新结扎，最好采用米勒结。使用双股结结扎子宫（如米勒结或改良版本）能将结扎产生的压力分散至更大面积。反过来与单股结相比，该打结法可以减少结扎以下部位的挤压和坏死，从而降低这类并发症的风险。
窦道与子宫残端肉芽肿
此类并发症由手术操作引起：如无菌操作技术较差、残留组织剩余过多或者使用了不可吸收的缝合线等。偶然情况下，子宫体残留肉芽肿可能体积过大而导致粪便阻塞、尿路梗阻。窦道可能由使用了不可吸收的缝线引起，如使用尼龙线已被证实会导致瘘管，即使价格低廉且易于操作，也不应使用。
虽然多数情况下，瘘管与肉芽肿可采用抗生素治疗达到短暂的效果，但几乎每种情况都需要通过手术发现病变部位从源头根治。通常，手术移除引起病变组织即可。
卵巢切除术与卵巢子宫切除术在并发症有无差异？
微创手术越来越流行，这让人们对卵巢切除术作为卵巢子宫切除术替代方案的潜在好处重新产生兴趣。一些回顾性研究比较了这两种手术的术后发病率和死亡率方面。
一项小型的前瞻性随机研究中，没有发现这两种手术在短期并发症（包括失血和开裂）、疼痛评分或手术伤口评分方面有任何差异（Peeters和Kirpensteijn 2011）。
虽然切除卵巢的动物的切口更短，但手术整体并没有看到差异，包括失血量、伤口闭合时间和手术整体长度。整体上看，现有数据并不支持全盘将卵巢切除术作为卵巢子宫切除术的替代方案。
